104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23270 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  842    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  39.44 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  37.2 
 
 		 417 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  37.63 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  35.73 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  32.94 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  33.25 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  33.86 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  29.93 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  32.66 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  33.7 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  30.63 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  30.47 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.58 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  31.9 
 
 		 479 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  29.7 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  32.94 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  28.61 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  27.23 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  40.14 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.85 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  39.05 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  49.28 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  37.01 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  37.01 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  37.01 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  37.86 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  34.23 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  26.91 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  35.24 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  25.75 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  26.99 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  35.35 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  36 
 
 		 511 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  46.97 
 
 		 530 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  34.95 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  47.27 
 
 		 512 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  27.09 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  41.46 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  32.69 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  31.68 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.4 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  29.63 
 
 		 602 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  40.54 
 
 		 650 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  38.75 
 
 		 681 aa  50.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  37.23 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 502 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  33.64 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  45.33 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  34.86 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  35.16 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  26.2 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  35.56 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 597 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  39.19 
 
 		 529 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  41.54 
 
 		 598 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29.13 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  34.21 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  34.21 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 563 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  38.81 
 
 		 515 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  38.81 
 
 		 515 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  38.81 
 
 		 515 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  38.81 
 
 		 616 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 552 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  37.14 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  38.57 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  39.06 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  32.73 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  35.87 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  37.88 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  36.05 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  40.98 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  40.98 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  40.98 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  31 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  37.14 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  25.77 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  35.62 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  27.33 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  32.35 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  31.25 
 
 		 616 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.51 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  32.77 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  38.03 
 
 		 535 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>