128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4880 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 522 aa  1005    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  56.03 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  55.62 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  53.98 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  54.53 
 
 		 529 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  56.02 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  52.35 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  52.35 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  52.35 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  49.12 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  50.48 
 
 		 510 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  52.17 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  35.28 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  32.34 
 
 		 547 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  31.62 
 
 		 611 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  32.11 
 
 		 522 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  31.79 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  28.6 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  29.49 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  25.95 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  23.53 
 
 		 412 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  29.55 
 
 		 540 aa  92  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  28.32 
 
 		 554 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  28.32 
 
 		 554 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  28.32 
 
 		 554 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  28.67 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.22 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  27.94 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  31.07 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  33.94 
 
 		 665 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  29.62 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  34.95 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  30.82 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.25 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  27.27 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  31.6 
 
 		 645 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 553 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  33.09 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  28.2 
 
 		 627 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  44.44 
 
 		 407 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  32.45 
 
 		 647 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  25.26 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  45.16 
 
 		 411 aa  54.3  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  31.32 
 
 		 399 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  31.97 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  38.14 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.28 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  29.22 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  46.77 
 
 		 535 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  26.8 
 
 		 616 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 563 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  50.91 
 
 		 392 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  32.05 
 
 		 454 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25.36 
 
 		 739 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.08 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  33.58 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  42.47 
 
 		 543 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  35.16 
 
 		 644 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  31.08 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  23.93 
 
 		 740 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  32.4 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  30.23 
 
 		 539 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 597 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  36.19 
 
 		 519 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.36 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.36 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.36 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 410 aa  47.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  30.77 
 
 		 616 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.75 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  38.39 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  30.61 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  29.38 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  37.35 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  34.75 
 
 		 639 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  47.27 
 
 		 531 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  36.11 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  37.88 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>