161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3284 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 447 aa  846    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  42.04 
 
 		 417 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  42.52 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  38.68 
 
 		 416 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  42.92 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  38.97 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  36.15 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  36.43 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  33.89 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  38.53 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 464 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  35.88 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 429 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  32.77 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  36.07 
 
 		 420 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  30.89 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 414 aa  120  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  31.62 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  33.65 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  29.22 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  28.47 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  47.48 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  47.62 
 
 		 458 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  30.12 
 
 		 412 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  27.61 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  38.85 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  37.82 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  39.35 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  39.52 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.82 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  38.26 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  36.5 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  32.5 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  40.19 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  36.7 
 
 		 528 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  37.29 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  35.42 
 
 		 609 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  40.3 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  40.3 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  40.3 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  34.58 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  29.9 
 
 		 602 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.11 
 
 		 486 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  38.38 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  43.24 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  41.46 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  40.18 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 611 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  35.29 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 597 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  41.1 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  41.96 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  39.73 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  44.07 
 
 		 525 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  34.38 
 
 		 538 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.27 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  33.83 
 
 		 510 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 517 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  32.29 
 
 		 520 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  36.7 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  36.36 
 
 		 397 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  35.64 
 
 		 515 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  35.56 
 
 		 540 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  35.64 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  35.64 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  42.37 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  29.01 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  35.35 
 
 		 485 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  33.77 
 
 		 648 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  35.11 
 
 		 665 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 659 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  33.63 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.17 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.69 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  36.46 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.71 
 
 		 601 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 552 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  46.55 
 
 		 514 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  36.46 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  38.14 
 
 		 522 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  32.32 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  38.95 
 
 		 515 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  34 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  28.7 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  29.59 
 
 		 647 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  37.1 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  32.97 
 
 		 505 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 600 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  30.08 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 372 aa  47.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  32.35 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 502 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>