123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1657 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  811    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  34.26 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  34.99 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  34.96 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  31.34 
 
 		 495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  34.94 
 
 		 392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  34.28 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  32.91 
 
 		 479 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  30.39 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  30.2 
 
 		 411 aa  116  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  33.42 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  30.02 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  30.31 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  29.32 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  30.58 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  29.4 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  32.06 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  46.46 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  28.38 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  39.13 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  43.88 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.19 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  28.49 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  26.49 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  31.44 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  30.6 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 740 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  28.62 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  27.42 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  36.59 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  31.3 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  28.53 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  48.15 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  48.15 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  48.15 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  30.61 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  50 
 
 		 525 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  43.37 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  30.24 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  28.14 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 494 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  39.25 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  50.88 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  32.8 
 
 		 512 aa  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 558 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  39.39 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  44.83 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.06 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  40.35 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  26.3 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  27.64 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  39.47 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  48.15 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  40.68 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  30.43 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  39.68 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  35.43 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 502 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  36.11 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  32.81 
 
 		 514 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  44.26 
 
 		 498 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  29.2 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  29.65 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  29.65 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  39.62 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  29.65 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  35 
 
 		 520 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  37.74 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  29.33 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  36.71 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  41.82 
 
 		 529 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  37.14 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.45 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  33.01 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.91 
 
 		 601 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.94 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  39.76 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  31.37 
 
 		 739 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  34.34 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  35.42 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 552 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  30.83 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>