110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4487 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 458 aa  865    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  32.09 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  37.36 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  31.57 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  34.63 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  33.82 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  39.01 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  34.13 
 
 		 395 aa  99.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  26.44 
 
 		 411 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  31.59 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  31.4 
 
 		 389 aa  90.1  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  32.64 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  48.54 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  46.46 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  32.66 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  53.66 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  32.6 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  31.92 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  32.94 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  28.78 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  27.35 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  56 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  36.9 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.2 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 597 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  31.69 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  46.75 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  47.37 
 
 		 616 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  45.31 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 236 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  36.73 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  41.3 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  38.71 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  20.5 
 
 		 740 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  50.82 
 
 		 485 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  36.26 
 
 		 514 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 501 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 413 aa  50.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  39.13 
 
 		 515 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  37.39 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  43.16 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  33.14 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  39.58 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  33.82 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  38.1 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  41.54 
 
 		 554 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  41.54 
 
 		 554 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.75 
 
 		 501 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  41.54 
 
 		 554 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.1 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  38.1 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.1 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.1 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.1 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.1 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  38.1 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 563 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  36.17 
 
 		 540 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  38.71 
 
 		 365 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  35.09 
 
 		 510 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.71 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.71 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.71 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.71 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.71 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  29.2 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  39.33 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  34.06 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 564 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  44.07 
 
 		 525 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.71 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  39.68 
 
 		 502 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.59 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.68 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.86 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.68 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  42.59 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  34.62 
 
 		 422 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 522 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>