100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2218 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 414 aa  801    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  90.31 
 
 		 414 aa  696    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  60.79 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  58.14 
 
 		 389 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  52.26 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  45.65 
 
 		 412 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  39.34 
 
 		 495 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  37.85 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  34.76 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  34.95 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  34.95 
 
 		 430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  36.01 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  34.55 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  32.27 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  33.8 
 
 		 425 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  33.07 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  34.03 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  36.09 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  33.25 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  32.52 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  29.72 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  48.51 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  31.1 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  31.58 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  29.06 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  28.72 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.53 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  28.7 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  37.89 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  36.89 
 
 		 520 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  23.7 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  24.43 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  43.9 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  42.11 
 
 		 535 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  27.98 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.24 
 
 		 540 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  28.36 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  25.32 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 563 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  36.96 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  26.62 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  25.45 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  40.86 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  36.23 
 
 		 502 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 659 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 515 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  38.96 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  41.46 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 487 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  40.48 
 
 		 485 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  42.17 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  40.23 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  41.76 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  37.29 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  43.86 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  37.29 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  43.66 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  37.29 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  37.1 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.89 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  36.05 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.17 
 
 		 480 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  32.65 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  29.25 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  35.35 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.35 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 529 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  38.78 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  50 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  36.56 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.21 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  38.81 
 
 		 515 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  32.89 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 		 505 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  36.26 
 
 		 365 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 598 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  38.81 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  38.81 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  32.95 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  43.59 
 
 		 486 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  36.21 
 
 		 515 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  38.71 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  27.09 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  29.66 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  39.18 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.22 
 
 		 601 aa  43.1  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  45.76 
 
 		 530 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>