193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3161 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 414 aa  811    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  53.81 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  53.69 
 
 		 399 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  47.75 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  43.03 
 
 		 420 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  36.71 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  34.19 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  35.35 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  34.26 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  34.03 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  33.6 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  31.56 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  30.67 
 
 		 406 aa  116  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  30.63 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  30.61 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  38.58 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  28.06 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  44.3 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38.81 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  27.51 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  25.99 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  37.06 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  28.88 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  41.25 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  28.74 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  27.72 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  45.57 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  34.95 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  33.58 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  27.21 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  36.17 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  35.21 
 
 		 665 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 564 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  35.56 
 
 		 739 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  27.12 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  45.95 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  44.59 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  40.45 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  27.32 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  26.19 
 
 		 555 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.82 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  51.67 
 
 		 525 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 659 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 477 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  35.51 
 
 		 515 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  31.76 
 
 		 511 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  28.36 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  40.28 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  27.61 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.26 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  36 
 
 		 520 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  39.51 
 
 		 644 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 553 aa  50.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  25.69 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  28.05 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  25.45 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  34.21 
 
 		 562 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.78 
 
 		 637 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  32.69 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  46.67 
 
 		 554 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  46.67 
 
 		 554 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  46.67 
 
 		 554 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  34.9 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  39.24 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  38.74 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  39.29 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  40.24 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  36.18 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  33 
 
 		 648 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  38.3 
 
 		 645 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  35.79 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  31.17 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  44.64 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  35.63 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  32.35 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  26.43 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  29.8 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  34.83 
 
 		 705 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  42.25 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  31.78 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>