114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1093 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 428 aa  784    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  35.09 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  35.89 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  36.52 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  35.4 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  35.82 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  35.54 
 
 		 458 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  37.28 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  33.05 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  30.72 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  51.03 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  29.73 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  46.97 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  55.56 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  27.82 
 
 		 425 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  48.62 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  30.77 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  44.78 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  38.85 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  47.17 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  30.92 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  29.2 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  27.6 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  40.15 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  48.33 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  48.33 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  48.33 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  50 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  40.79 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  43.24 
 
 		 562 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.58 
 
 		 601 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  31.23 
 
 		 399 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  44.76 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  26.8 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  41.05 
 
 		 365 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  27.51 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 557 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  36.26 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  55.17 
 
 		 522 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  43.84 
 
 		 505 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  42.86 
 
 		 538 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.89 
 
 		 540 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  33.88 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  26.48 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  41.07 
 
 		 600 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  26.57 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  39.76 
 
 		 616 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  39.52 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  43.37 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  36.46 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 558 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 597 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  47.46 
 
 		 547 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  37.18 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 563 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  33.58 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 537 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  42.86 
 
 		 616 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  41.86 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.56 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.11 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  40.74 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  39.29 
 
 		 602 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  37.8 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.01 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.01 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  44.64 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 528 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  31.01 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  31.01 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.01 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.01 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  39.34 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  26.8 
 
 		 740 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  31.01 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.07 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  42.59 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.33 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.33 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.33 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.33 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.33 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  39.66 
 
 		 518 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 614 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 502 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>