201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3370 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 460 aa  869    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  38.41 
 
 		 498 aa  232  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  37.98 
 
 		 505 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  34.47 
 
 		 524 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  33.55 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  37.78 
 
 		 501 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  31.78 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.51 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  29.96 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  44.74 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  32.21 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.75 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  38.16 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  43.02 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.63 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  31.75 
 
 		 647 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  40.54 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  40.78 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  42.11 
 
 		 648 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  35.53 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  42.67 
 
 		 665 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.65 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  50.85 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  39.76 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  50.85 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  50.85 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.88 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  30.88 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  45.16 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.28 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 557 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  35.37 
 
 		 362 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  39.71 
 
 		 639 aa  56.6  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  41.25 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  36.84 
 
 		 627 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  50.85 
 
 		 538 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 405 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  33.99 
 
 		 515 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  34.06 
 
 		 365 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  38.16 
 
 		 525 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  38.36 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  30.25 
 
 		 739 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.13 
 
 		 558 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38.55 
 
 		 505 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 539 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  32.53 
 
 		 740 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 399 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  39.53 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 530 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  38.1 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  36.9 
 
 		 614 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  34.25 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  25.37 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  36.05 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  33 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  43.24 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  27.73 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  24.63 
 
 		 353 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  26.89 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.3 
 
 		 601 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  37.04 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  40.79 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  41.3 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  34.21 
 
 		 520 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 405 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  38.1 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  42.86 
 
 		 536 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 659 aa  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  22.16 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 549 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  30.86 
 
 		 493 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  27.53 
 
 		 387 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  34.57 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  41.94 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  27.53 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  27.53 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  48.28 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>