130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2943 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 468 aa  884    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  32.14 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  33.59 
 
 		 524 aa  93.2  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  43.17 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  39.1 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.12 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  40.58 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.88 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  44.19 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  26.13 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.79 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  27.37 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  37.21 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  31.21 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  33.05 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  29.38 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  29.23 
 
 		 648 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  38.67 
 
 		 547 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 552 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.86 
 
 		 540 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 563 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 		 442 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 553 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  30.21 
 
 		 740 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  21.84 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  36.04 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  52.08 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  46.67 
 
 		 538 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 381 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  42.59 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  42.59 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  42.59 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  41.33 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  36.47 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  34.72 
 
 		 515 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  34.81 
 
 		 495 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  30.48 
 
 		 665 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  37.93 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  21.36 
 
 		 371 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  40.85 
 
 		 389 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 537 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 478 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.41 
 
 		 619 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 543 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  21.84 
 
 		 371 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  21.84 
 
 		 371 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  21.84 
 
 		 371 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  40.54 
 
 		 392 aa  50.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  21.84 
 
 		 371 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  44.83 
 
 		 637 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  21.36 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  26.24 
 
 		 562 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  35.62 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  43.33 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  37.88 
 
 		 611 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  43.55 
 
 		 543 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  43.66 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  29.62 
 
 		 553 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  43.1 
 
 		 644 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  36.67 
 
 		 530 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  40.35 
 
 		 511 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  38.81 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.34 
 
 		 520 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  41.51 
 
 		 512 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  38.18 
 
 		 529 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  29.81 
 
 		 585 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  30.39 
 
 		 616 aa  47  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 537 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  35.11 
 
 		 417 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  22.6 
 
 		 371 aa  46.6  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  37.33 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.6 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  36.49 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  30.53 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  35.04 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  38.6 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  39.13 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  48.98 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  28.69 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  45.28 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  39.29 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  44 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  39.71 
 
 		 645 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  44 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  44 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  44 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>