108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0930 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 464 aa  891    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  65.87 
 
 		 495 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  46.02 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  41.27 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  39.63 
 
 		 389 aa  210  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  40.46 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  40.96 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  36.9 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  38.33 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  34.17 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  38.92 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  37.89 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  34.44 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  35.86 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  36.03 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  37.63 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  33.77 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  34.46 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  37.33 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  150  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  34.93 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  31.94 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  58.33 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  32.44 
 
 		 420 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  30.91 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  39.13 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  39.13 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  39.13 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  32.25 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  28.19 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29.97 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  35.33 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  41.58 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40.43 
 
 		 540 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  36.55 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  26.91 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 558 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 537 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  42.53 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  35.43 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  24.55 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 		 547 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  26.52 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 563 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  35.8 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 481 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  27.79 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  28.25 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  29.49 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  26 
 
 		 542 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  41.67 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  40.98 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  45.76 
 
 		 611 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  46.55 
 
 		 512 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.36 
 
 		 601 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  37.84 
 
 		 515 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  26.38 
 
 		 414 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  27.16 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  29.21 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  32.43 
 
 		 616 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  24.87 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  39.39 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  36.36 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  22.7 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  22.7 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 659 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  26.08 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  41.54 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  35.53 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  29.54 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  30.23 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  36.05 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  34.38 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  39.29 
 
 		 529 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  35.06 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  35.9 
 
 		 402 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  33.9 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 740 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  38.98 
 
 		 511 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.89 
 
 		 501 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>