206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  820    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  40.74 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  37.06 
 
 		 414 aa  200  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  38.72 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  34.18 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  37 
 
 		 421 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  33.25 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  35.54 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  35.03 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  32.95 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  33.16 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  32.73 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  31.43 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  30.87 
 
 		 389 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  30.32 
 
 		 376 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  29.59 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  28.25 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  26.49 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  50.88 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  26.33 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  39.09 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  28.99 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  31.28 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  38.37 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  26.89 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  40.45 
 
 		 525 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  25.16 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  47.14 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  25.41 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  31.65 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  40.3 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  34.9 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  38.37 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  29.77 
 
 		 518 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  30.97 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  26.76 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.82 
 
 		 555 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  29.25 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  39.33 
 
 		 525 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  46.97 
 
 		 543 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  45.31 
 
 		 554 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  45.31 
 
 		 554 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.48 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  45.31 
 
 		 554 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.48 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.48 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  27.49 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  27.52 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  46.03 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  46.77 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  38.74 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  27.1 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  39.74 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  29.07 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  39.74 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  30.15 
 
 		 739 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  39.74 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  27.99 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  31.25 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  44.78 
 
 		 538 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  37.38 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 553 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  26.68 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  44.62 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  31.37 
 
 		 539 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  36.96 
 
 		 537 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.54 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 477 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 		 705 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  33.91 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  33.91 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  30.66 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  37.31 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  37.08 
 
 		 515 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  36 
 
 		 305 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>