231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1477 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 422 aa  836    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  40.74 
 
 		 418 aa  272  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  33.76 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  34.11 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  31.98 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  32.69 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  33.69 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  30.08 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  29.55 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  31.21 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  28.53 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  29.64 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  31.2 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  29.17 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  28.49 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  32.63 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  39.71 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  26.74 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  25.45 
 
 		 740 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  36.11 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  36.11 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  26.76 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  36.11 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.11 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.11 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.11 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  29.09 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  32.77 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  26.05 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  31.15 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  35.1 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  41.18 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  41.18 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.78 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  29.8 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 564 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  43.86 
 
 		 555 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  27.88 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  25.59 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  24.75 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  37.36 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  39.47 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  23.97 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  25.92 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  29.55 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.87 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  26.15 
 
 		 399 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  37.61 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  29.34 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  41.33 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  31.17 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  27.32 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.67 
 
 		 739 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  39.02 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  37.36 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  40.58 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  32.17 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.17 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  32.17 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  49.12 
 
 		 383 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.17 
 
 		 385 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  32.17 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.17 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 552 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.17 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  35.53 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38.2 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  43.02 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  36.05 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 558 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  32.32 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.69 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.37 
 
 		 601 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1607  transcriptional regulator, CdaR  33.11 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.69 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  30.31 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.69 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.69 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.69 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  32.43 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  38.2 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 553 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  39.13 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  37.97 
 
 		 542 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>