247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2723 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 
429 aa  863    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  72.44 
 
 
418 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  63.16 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  62.01 
 
 
428 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  61.01 
 
 
414 aa  448  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  61.48 
 
 
428 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  61.48 
 
 
428 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  61.21 
 
 
428 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  52.82 
 
 
413 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  51.17 
 
 
393 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  44.44 
 
 
397 aa  295  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  43.59 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  45.79 
 
 
429 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  39.9 
 
 
414 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  41.49 
 
 
386 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  40.15 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  46.01 
 
 
384 aa  270  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
403 aa  269  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 
392 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  44.22 
 
 
421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  43.05 
 
 
419 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  44.78 
 
 
425 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
425 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  44.09 
 
 
420 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  39.95 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  41.1 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  40.58 
 
 
408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  40.89 
 
 
393 aa  250  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  42.75 
 
 
404 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  41.78 
 
 
473 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  44.53 
 
 
373 aa  245  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  38.26 
 
 
539 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
408 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  40.43 
 
 
394 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  50.96 
 
 
453 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  46.3 
 
 
276 aa  91.3  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  37.86 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  28.16 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  34.35 
 
 
388 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.3 
 
 
563 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  50.82 
 
 
537 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  43.28 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.08 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.18 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  48.28 
 
 
540 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  35.16 
 
 
554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 
547 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  35.16 
 
 
554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  35.16 
 
 
554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
494 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  32.28 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  43.94 
 
 
454 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  40.32 
 
 
376 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.27 
 
 
445 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  42.31 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 
558 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  36.84 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
526 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  43.94 
 
 
393 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  38.16 
 
 
363 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
305 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  47.37 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  48.94 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  35.92 
 
 
515 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  47.92 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  35.92 
 
 
515 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  35.92 
 
 
515 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  33.12 
 
 
681 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  53.33 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  44.26 
 
 
529 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  35.59 
 
 
512 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  39.47 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  42.37 
 
 
363 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  25.7 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  40.3 
 
 
493 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  26.09 
 
 
385 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  47.92 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  29.26 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  36.84 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  36.84 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  36.84 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  26.2 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  38.57 
 
 
540 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  36.84 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  39.24 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  44.07 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  43.1 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  38.16 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  27.3 
 
 
389 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.1 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  40.62 
 
 
413 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 
436 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  43.1 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  47.83 
 
 
383 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>