244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3619 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 408 aa  783    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  96.08 
 
 		 473 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  67.36 
 
 		 386 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  56.96 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  52.11 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  53.08 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  53.65 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  54.71 
 
 		 408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  53.49 
 
 		 420 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  51.59 
 
 		 419 aa  342  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  52.77 
 
 		 425 aa  342  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  54.62 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  48.82 
 
 		 414 aa  335  7e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  52.23 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  52.05 
 
 		 421 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  49.08 
 
 		 426 aa  322  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  51.17 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  52.49 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.27 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  52.96 
 
 		 373 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  49.87 
 
 		 393 aa  312  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  48.67 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  55.15 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  44.94 
 
 		 539 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  50.79 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.47 
 
 		 418 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  49.3 
 
 		 393 aa  270  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  45.03 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  42.89 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  43.92 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  43.92 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  44.7 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  43.67 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  42.97 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  41.61 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  39.63 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  33.17 
 
 		 246 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32.82 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 305 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  45.71 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  51.85 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  46.38 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  44.93 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  47.83 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.42 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  31.21 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  37.31 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  41.1 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  44.68 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  40 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  40 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  40.98 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.67 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  41.54 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  46.48 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  46.48 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  46.48 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  39.68 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  43.37 
 
 		 530 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  43.56 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 532 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  39.62 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  38.89 
 
 		 363 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  35.82 
 
 		 540 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  32.08 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  38.33 
 
 		 454 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  32.32 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  32.32 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  36.84 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  27.11 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  32.32 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  19.46 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  32.08 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  46.55 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  31.13 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  39.53 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  19.46 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  34.33 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  42.22 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  45.16 
 
 		 511 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  39.34 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  40 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.34 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 494 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  41.27 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  32.98 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  37.37 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  25.36 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>