210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5661 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 494 aa  991    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 553 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25.88 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.12 
 
 		 555 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  25.05 
 
 		 538 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  23.45 
 
 		 558 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.71 
 
 		 601 aa  90.1  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  25.16 
 
 		 585 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  33.13 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  27.66 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  25.36 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  31.21 
 
 		 609 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  26.76 
 
 		 627 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 586 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  27.18 
 
 		 619 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  24.53 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  29.92 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  27.06 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  44.21 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  33.33 
 
 		 536 aa  66.6  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.47 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  31.82 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  42.27 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  41.94 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  31.79 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  27.71 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  23.19 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  28.82 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  38 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.69 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  22.88 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  43.96 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  30.38 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  28.24 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  30.36 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 535 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.54 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  40.82 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.26 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  26.98 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  38.1 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  37.11 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  26.98 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  33.08 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  30.14 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  38 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  41.49 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  43.75 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  35.44 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  34.91 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.63 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  24.62 
 
 		 502 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  32.37 
 
 		 614 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.62 
 
 		 492 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  33.06 
 
 		 644 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  21.83 
 
 		 406 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  25.19 
 
 		 547 aa  57  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  43.59 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  36.56 
 
 		 602 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  26.71 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  26.29 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  37.36 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  36.47 
 
 		 648 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  38.14 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.01 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  31.76 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  35.4 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  40.91 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.73 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  35.24 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 405 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  26.79 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  30.2 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 526 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  25.94 
 
 		 512 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  28.38 
 
 		 311 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  23.44 
 
 		 408 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  42.17 
 
 		 485 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 407 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  21.13 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  38.89 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  37.5 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25.36 
 
 		 618 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  36.08 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  24.08 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  29.41 
 
 		 388 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.57 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.57 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>