192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2149 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 408 aa  778    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  72.93 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  70.93 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  73.73 
 
 		 394 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  68.09 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  55.1 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  54.21 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  52.14 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  54.01 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  54.25 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  52.06 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  50.27 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  55.01 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  53.98 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  53.46 
 
 		 384 aa  322  6e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  55.67 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  48.93 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  43.02 
 
 		 539 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  46.3 
 
 		 413 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 429 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  46.26 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  43.16 
 
 		 418 aa  256  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  47.47 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  40.58 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  40.68 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  40.16 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  41.98 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  41.98 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  41.98 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  42.15 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  46.36 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  40.44 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  25.82 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  33.05 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  31.54 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.07 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.44 
 
 		 480 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.07 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  30.57 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  38.46 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  35.77 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  33.59 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  34.9 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  43.84 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  43.02 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  36.24 
 
 		 616 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  22.46 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  35.82 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  34.9 
 
 		 611 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  24.42 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 466 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  24.42 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  54.35 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  34.97 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  35.61 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29.7 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  49.12 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  49.12 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  49.12 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  36.76 
 
 		 518 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  40.82 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  22.89 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  37.35 
 
 		 558 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  35.35 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  22.89 
 
 		 371 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  22.73 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  23.84 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  34.76 
 
 		 537 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  42.17 
 
 		 485 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  50.91 
 
 		 529 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  26.58 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  30.43 
 
 		 602 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  32.18 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.9 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>