234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1642 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 393 aa  784    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  63.61 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  61.01 
 
 		 420 aa  441  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  62.3 
 
 		 373 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  57.33 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  57.89 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  49.6 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  51.19 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  50.66 
 
 		 386 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  52.14 
 
 		 408 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  49.73 
 
 		 419 aa  345  7e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  52.94 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  48.17 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  51.94 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  52.63 
 
 		 473 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  48.04 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  50.26 
 
 		 413 aa  319  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  48.17 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  45.15 
 
 		 539 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  50.78 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  45.04 
 
 		 400 aa  302  8.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.56 
 
 		 418 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  46.42 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  47.64 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  43.59 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  41.21 
 
 		 428 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  42.41 
 
 		 428 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  42.41 
 
 		 428 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  40.98 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  42.15 
 
 		 428 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.92 
 
 		 414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 479 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  45.45 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  43.69 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  31.9 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  28.28 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  37.06 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.65 
 
 		 480 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  36.15 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  27.32 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  30.71 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  48.48 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  39.05 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  53.45 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  47.46 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  42.65 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  39.73 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  41.94 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  32.56 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 563 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32.03 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  42.25 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  20.58 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29.06 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  44.62 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  39.52 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  27.94 
 
 		 520 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  33.73 
 
 		 558 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  46.38 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  28.57 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  58.14 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  41.56 
 
 		 514 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 517 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  31.82 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  31.82 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 552 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  26.09 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 		 600 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  31.51 
 
 		 492 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  35.14 
 
 		 363 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  45.76 
 
 		 554 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  45.76 
 
 		 554 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  43.1 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  45.76 
 
 		 554 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  27.35 
 
 		 371 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.5 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  38.6 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  27.35 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.6 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.56 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  45.16 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  41.46 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  36.07 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  34.43 
 
 		 518 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>