245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12271 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  832    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  76.77 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  76.77 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  76.53 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  75.25 
 
 		 428 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  74.45 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  63.98 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  61.01 
 
 		 429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  51.96 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  51.31 
 
 		 393 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  44.19 
 
 		 421 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  40.99 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  40.52 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  44.96 
 
 		 429 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  40.92 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  40.78 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  40.46 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  39.95 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  40.61 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  43.26 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  43.3 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  44.96 
 
 		 473 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  42.15 
 
 		 408 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  39.53 
 
 		 539 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  40.36 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  41.41 
 
 		 373 aa  239  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  40.31 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  42.56 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  42.53 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  39.22 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  49.04 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  36.5 
 
 		 276 aa  93.6  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  46.27 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  22.31 
 
 		 562 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  36.92 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  52.05 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  47.83 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  40.57 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  55.81 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  46.55 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  31.28 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  43.04 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  43.04 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  43.04 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  22.89 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  42.35 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  34.78 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  40.87 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 478 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  24.69 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.48 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  23.62 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  40.85 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  28.52 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  23.87 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  36.67 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  23.87 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  55.1 
 
 		 538 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  39.44 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  50 
 
 		 681 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  30.41 
 
 		 512 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  23.87 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  42.19 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  51.02 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 517 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  37.78 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  42.19 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  48.84 
 
 		 505 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 502 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.61 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 		 388 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  42.59 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  48.28 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  34.29 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  45.28 
 
 		 537 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.38 
 
 		 619 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  35.37 
 
 		 644 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>