83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1836 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 384 aa  760    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  36.24 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  29.21 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  28.19 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  29.69 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  26.01 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  27.1 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  26.36 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  27.08 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  50 
 
 		 525 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  26.98 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  26.72 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  34.38 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  34.38 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  28.07 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  26.6 
 
 		 287 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  26.6 
 
 		 287 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  41.51 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  27.03 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  34.48 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  34.48 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  37.65 
 
 		 554 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  37.65 
 
 		 554 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  37.65 
 
 		 554 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  39.44 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  35.19 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  35.19 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 		 528 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  35.19 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  29.85 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  37.04 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  29.25 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  38.27 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.92 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  45.1 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  33.82 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  39.62 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  43.64 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  34.59 
 
 		 276 aa  47  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  42.31 
 
 		 538 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  26.57 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  31.91 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  41.51 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  41.51 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  25.86 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  25.35 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  31.91 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  41.51 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  43.18 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  26.41 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  25.87 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1425  putative transcriptional regulator, PucR family  39.58 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  47.17 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  24.23 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  27.85 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  41.51 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  25.75 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  44.9 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  37.1 
 
 		 493 aa  43.5  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  41.51 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  41.51 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  27.88 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  34 
 
 		 300 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  42 
 
 		 404 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  38.6 
 
 		 512 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  31.71 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>