159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13710 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  100 
 
 		 393 aa  810    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.8 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 514 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  33.11 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  35.64 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  34.31 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.03 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  31.2 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  34.52 
 
 		 602 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40.26 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.1 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  27.59 
 
 		 524 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  30.49 
 
 		 553 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  27.87 
 
 		 505 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  28 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  30.23 
 
 		 645 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  28 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  28 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  28.25 
 
 		 525 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.41 
 
 		 665 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  30.38 
 
 		 614 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  27.52 
 
 		 637 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.28 
 
 		 518 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  27.34 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  33.33 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  28.79 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  30.68 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  30.21 
 
 		 525 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  32.19 
 
 		 504 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  31.58 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 516 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  34.18 
 
 		 519 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  34.67 
 
 		 650 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.59 
 
 		 558 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  35.53 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  38.33 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  31.68 
 
 		 528 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50790  hypothetical protein  39.66 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937212  hitchhiker  0.00694417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.81 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  29.29 
 
 		 493 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3177  CdaR transcriptional regulator  38.98 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  32 
 
 		 540 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  32.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  31.71 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  29.45 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1437  CdaR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2539  transcriptional regulator, CdaR  38.98 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  32.77 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  30.26 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  26.28 
 
 		 619 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  36.36 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  26.83 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  29.63 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2691  transcriptional regulator, CdaR  38.98 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  25.61 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  28.74 
 
 		 644 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2673  transcriptional regulator, CdaR  37.29 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0615728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 552 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  39.13 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 597 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  34.92 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  28.03 
 
 		 542 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  28.57 
 
 		 648 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  28.46 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  40.28 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  40.28 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  36.11 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  27.97 
 
 		 520 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  27.19 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  38.18 
 
 		 511 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  32.18 
 
 		 520 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  41.07 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  30 
 
 		 639 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4330  hypothetical protein  35.94 
 
 		 370 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  34.67 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  30.14 
 
 		 627 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  24.76 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  19.3 
 
 		 399 aa  46.2  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  40.35 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  26.04 
 
 		 600 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  41.38 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  28.4 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>