127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6547 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 413 aa  839    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  71.66 
 
 		 379 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  25.99 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  38.69 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  29.27 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  34.07 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  24.81 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  24.31 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  35.34 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  48.39 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  34.59 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  31.62 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  25.07 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  27.54 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  32.09 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  28.33 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  32.09 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  26.32 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  26.6 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  31.06 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  34.78 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  33.56 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  28.2 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  33.91 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  23.1 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  35.8 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  26.6 
 
 		 488 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  23.68 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.11 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  48.98 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  31.25 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  33.04 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  24.19 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  46 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 563 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  46 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  26.28 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  46 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  25.81 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  26.13 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  25.81 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  26.13 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  32.17 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  25.2 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  43.1 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 477 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  41.43 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  39.68 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  23.17 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  45.1 
 
 		 538 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  34.29 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  24.44 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  32.82 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  25.1 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  32.97 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  38.75 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  26.38 
 
 		 525 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  30.21 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 305 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1607  transcriptional regulator, CdaR  25.56 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  31.08 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  26.8 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  29.85 
 
 		 495 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 481 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  27.71 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  39.06 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  41.38 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.74 
 
 		 739 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 515 aa  46.6  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  25 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  24.03 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  42.37 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  36.51 
 
 		 168 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  28.02 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  34.51 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  41.38 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  37.93 
 
 		 616 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.28 
 
 		 601 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  25.33 
 
 		 562 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  24.44 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  29.41 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  35.48 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>