223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3425 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  99.77 
 
 
428 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  850    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  82.5 
 
 
428 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  99.77 
 
 
428 aa  848    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  80.92 
 
 
428 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  76.53 
 
 
414 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  62.69 
 
 
418 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  61.21 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  52.07 
 
 
413 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 
393 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.99 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  41.9 
 
 
393 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 
386 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  46.29 
 
 
429 aa  270  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  42.97 
 
 
392 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  41.33 
 
 
414 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  44.95 
 
 
384 aa  259  7e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  42.29 
 
 
419 aa  256  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  41.81 
 
 
420 aa  255  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  41.6 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  44.93 
 
 
425 aa  252  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  42.71 
 
 
400 aa  251  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  40.19 
 
 
539 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  40.37 
 
 
397 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  41.98 
 
 
408 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  44.53 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
408 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  43.32 
 
 
425 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
403 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  42.44 
 
 
397 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  43.47 
 
 
373 aa  236  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  43.04 
 
 
404 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  39.47 
 
 
394 aa  223  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  41.1 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
479 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  50 
 
 
453 aa  100  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  40.97 
 
 
276 aa  89.7  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  40.15 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
526 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.08 
 
 
480 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  25.73 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.54 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  63.04 
 
 
538 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  26.56 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  26.56 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  26.56 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  26.56 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  34.27 
 
 
637 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  24.23 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  40.59 
 
 
407 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  47.62 
 
 
554 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  47.62 
 
 
554 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  47.62 
 
 
554 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  25.82 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  52.08 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  45 
 
 
305 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  40.85 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  44.71 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  30.89 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  40.35 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  53.49 
 
 
501 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  40 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  39.13 
 
 
681 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  39.24 
 
 
540 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  37.4 
 
 
405 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  41.18 
 
 
558 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  31.68 
 
 
510 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
659 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  41.38 
 
 
371 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  44.44 
 
 
379 aa  53.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  49.09 
 
 
540 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 
371 aa  53.5  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  52.08 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
429 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
552 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
563 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
429 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  28.24 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
429 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  42.17 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  45.9 
 
 
367 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  38.75 
 
 
547 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  36.49 
 
 
388 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  39.74 
 
 
418 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  47.83 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  26.79 
 
 
246 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  35.09 
 
 
512 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  41.79 
 
 
485 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  41.79 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  46.15 
 
 
459 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.37 
 
 
364 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  47.92 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 
537 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  54.35 
 
 
525 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
494 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>