223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2948 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 420 aa  816    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  77.27 
 
 		 373 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  61.52 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  60.8 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 403 aa  358  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  54.94 
 
 		 421 aa  358  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  51.37 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  55.93 
 
 		 384 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  53.73 
 
 		 408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  52.36 
 
 		 392 aa  333  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  50.12 
 
 		 419 aa  329  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  54.43 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  47.28 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  54.64 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 386 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  54.38 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  53.09 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  47.93 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  52.01 
 
 		 425 aa  309  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  46.46 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  46.49 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.65 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  48.03 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40.84 
 
 		 418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  41.98 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.17 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  47.12 
 
 		 429 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  42.14 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  42.14 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  42.04 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  41.9 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.46 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  47.18 
 
 		 276 aa  106  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  43.69 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  35.45 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  40.95 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  27.22 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  36.04 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  27.22 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  26.63 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  30.95 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  26.79 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  32.73 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.04 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  26.04 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  35.98 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  36.3 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  36.88 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  30.21 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  30.57 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  44.83 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.57 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  50.82 
 
 		 517 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  44.29 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 493 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.62 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  50.77 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  42.86 
 
 		 562 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.69 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  41.1 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  40.3 
 
 		 540 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  55.32 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  36.92 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 558 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  32.39 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 525 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  38.81 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  38.55 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 514 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 526 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  44.16 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  37.31 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  35.85 
 
 		 511 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  40.45 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  44.26 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  36.51 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  44.9 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 552 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  47.17 
 
 		 385 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  45.07 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  30.86 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  33.82 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>