231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2307 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 365 aa  708    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  37.44 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.35 
 
 		 501 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  27.44 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  49.18 
 
 		 554 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  49.18 
 
 		 554 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  49.18 
 
 		 554 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  52.38 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  36.04 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  48.21 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  36.72 
 
 		 739 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.46 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  31.22 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  28.24 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  49.32 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.49 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  52.54 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 563 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  47.06 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  33.63 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  45.61 
 
 		 538 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  44.07 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  49.21 
 
 		 530 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  52.73 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  46.58 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  41.94 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  37.61 
 
 		 616 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 468 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  39.76 
 
 		 425 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29.63 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 537 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  51.72 
 
 		 557 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  45.61 
 
 		 540 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  44.07 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  30.28 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 552 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  43.1 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  49.15 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  45 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  30.28 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 406 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  46.67 
 
 		 520 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  43.24 
 
 		 518 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  28.37 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  28.37 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  45 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.5 
 
 		 601 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  31.4 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  29.79 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  28.37 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  45.61 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 553 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  41.05 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  45.61 
 
 		 616 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.61 
 
 		 609 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  33.7 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  25.6 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  49.06 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  37.98 
 
 		 637 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  48.28 
 
 		 561 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  46.55 
 
 		 512 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  42.53 
 
 		 543 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  61.11 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  61.11 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  61.11 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  61.11 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  34.31 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  32.22 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  39.66 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  31.47 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  32.58 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  48.15 
 
 		 493 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  23.08 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.25 
 
 		 486 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40 
 
 		 418 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  46.77 
 
 		 553 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.62 
 
 		 740 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  45.45 
 
 		 353 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  46.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  33.1 
 
 		 460 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  40 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  55.56 
 
 		 404 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>