136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7076 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 421 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  36.59 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  37.04 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  36.21 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  36.27 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  33.67 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  34.58 
 
 		 422 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  35.99 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  28.97 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  33.65 
 
 		 402 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  29.69 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 462 aa  90.5  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  28.8 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  27.83 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  25.57 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  27.59 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  26.71 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  43.4 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  44.94 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  40.78 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  42.31 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.95 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25.12 
 
 		 739 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  38.83 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  38.38 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  39.1 
 
 		 645 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  37 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 558 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  26.07 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  38.89 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  43.88 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 552 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.04 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  41.41 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  35.37 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  27.49 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 487 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  24.94 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  30.4 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  36.27 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  40.66 
 
 		 644 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  27.33 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.46 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  33.98 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  40 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  25.74 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  27.66 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 517 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  32.4 
 
 		 637 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  36.23 
 
 		 528 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  35.87 
 
 		 616 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  24.63 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  27.58 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  28.06 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  31.58 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  22.93 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.83 
 
 		 601 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.22 
 
 		 705 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  30.27 
 
 		 614 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  39.39 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.88 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.88 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.09 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  27.2 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.88 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.88 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.88 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.88 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  24.62 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  38.71 
 
 		 555 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  37.89 
 
 		 492 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  38.03 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  26.96 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  27.48 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 563 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32.61 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>