101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2075 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  799    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  90.31 
 
 		 414 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  61.42 
 
 		 395 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  58.4 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  53.02 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  43.65 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  39.59 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  35.01 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  37.12 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  36.06 
 
 		 419 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  36.01 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  36.44 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  35.16 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  34.88 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  34.04 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  33 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  33.07 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  33.85 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  33.17 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  31.01 
 
 		 415 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  33.25 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  45.36 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  28.86 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  30.33 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  28.47 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  25.52 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  35.48 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  36.89 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.53 
 
 		 540 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  42.11 
 
 		 535 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  25.19 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  34.46 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  42.16 
 
 		 531 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  29.52 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40.45 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.27 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 563 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  39.53 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  35.59 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  35.59 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  35.59 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  35.54 
 
 		 502 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  37.66 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  35.48 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  37.36 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  34.92 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  41.77 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.7 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  38.14 
 
 		 553 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 659 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  34.92 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  26.87 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  43.66 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  34.04 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  32.69 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  34.26 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.85 
 
 		 601 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  34.21 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  32.08 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  32.94 
 
 		 547 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  25.32 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  28.92 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  27.36 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 515 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.53 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  31.13 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  33.68 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  31.2 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  36.23 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 558 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  36.11 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 529 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  50 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 598 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1607  transcriptional regulator, CdaR  31.13 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  32.56 
 
 		 487 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 		 505 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  39.53 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  32.89 
 
 		 512 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>