276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1035 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 502 aa  972    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  60.16 
 
 		 485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  46.84 
 
 		 486 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  46.17 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  45.79 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  39.61 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  41.86 
 
 		 598 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  33.78 
 
 		 504 aa  173  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.31 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  32.25 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  31.68 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.41 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 517 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  46.71 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  29.1 
 
 		 555 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  30.27 
 
 		 535 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.95 
 
 		 565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  46.01 
 
 		 491 aa  123  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.22 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.69 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.85 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  49.66 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.64 
 
 		 492 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  32.39 
 
 		 531 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.68 
 
 		 558 aa  107  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 586 aa  97.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  29.54 
 
 		 536 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  28.88 
 
 		 520 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.38 
 
 		 596 aa  90.5  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 516 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.56 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  43.18 
 
 		 454 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  26.56 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.23 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  32.99 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  34.27 
 
 		 566 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.06 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  36.24 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.12 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  33.14 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  27.33 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  50.63 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 552 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  30.59 
 
 		 557 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  50.65 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  35.5 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  39.2 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  42.45 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  35.45 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.93 
 
 		 740 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  35.86 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  32.69 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  33.08 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.27 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  32.3 
 
 		 539 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  39 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  41.07 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  38.46 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.46 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  43.04 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  43.24 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 561 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.59 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  33.61 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  39.09 
 
 		 518 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.73 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  33.82 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  35.56 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  38.61 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.52 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.67 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  37.72 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  39.74 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  27.78 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  31.65 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  35.63 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>