231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0691 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 486 aa  930    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  60.58 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  48.98 
 
 		 485 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  38.97 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  41.8 
 
 		 502 aa  223  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  42.37 
 
 		 598 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.57 
 
 		 535 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  32.56 
 
 		 519 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  47.09 
 
 		 558 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  34.31 
 
 		 491 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.38 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  31.58 
 
 		 504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.3 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  35.59 
 
 		 531 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  30.12 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  29.55 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.18 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  45.66 
 
 		 456 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  31.27 
 
 		 501 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  41.8 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.31 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.85 
 
 		 445 aa  94.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.16 
 
 		 502 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.43 
 
 		 565 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.97 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.54 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  34.24 
 
 		 555 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  36.78 
 
 		 487 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.43 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  26.92 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  35.54 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.36 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.36 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  32.05 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  37.59 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  37.96 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  36.03 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.26 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 543 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.56 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  28.12 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  33.52 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.83 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  40.34 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  32.87 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.26 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  50.77 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  29.86 
 
 		 532 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  31.29 
 
 		 575 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  34.04 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  36.71 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  35.54 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  33.33 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  26.24 
 
 		 555 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  22.12 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  29.35 
 
 		 614 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  25 
 
 		 523 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  42.5 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  36.87 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  52.46 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  45.78 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  30.43 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  53.33 
 
 		 392 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 523 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 597 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 235 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  46.88 
 
 		 562 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  23.48 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  46.75 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.85 
 
 		 665 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 524 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  41.33 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  33.65 
 
 		 524 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  44.76 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 537 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.03 
 
 		 562 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 305 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  44.93 
 
 		 547 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 517 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  33.55 
 
 		 543 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>