138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3382 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  68.38 
 
 		 536 aa  671    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  68.56 
 
 		 566 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 547 aa  1051    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  60.04 
 
 		 534 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 546 aa  565  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  53.29 
 
 		 596 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  56.48 
 
 		 575 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 586 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  51.29 
 
 		 536 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  40.39 
 
 		 542 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 542 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 542 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  37.14 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.01 
 
 		 523 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.25 
 
 		 533 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  39.59 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.32 
 
 		 557 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.44 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  31.16 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.89 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.6 
 
 		 537 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  35.96 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.53 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  36.72 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 500 aa  107  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 553 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.37 
 
 		 558 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.15 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.74 
 
 		 538 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 558 aa  97.8  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 549 aa  93.6  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 235 aa  90.9  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.14 
 
 		 609 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  36.25 
 
 		 549 aa  87  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  35.54 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  28.67 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.07 
 
 		 562 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  26.23 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  33.94 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  31.6 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  26.27 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  33.52 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  33.68 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.55 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  30.32 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.25 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  33.96 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  35.33 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.59 
 
 		 601 aa  70.5  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  35.88 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.26 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  35.96 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  31.34 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  26.36 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  25.39 
 
 		 645 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.93 
 
 		 740 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  25.29 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.06 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  31.62 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  23.96 
 
 		 618 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  26.33 
 
 		 627 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  27.36 
 
 		 665 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  26.18 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  36.63 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 502 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.01 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.62 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.62 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.62 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  28.1 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  32.72 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  22.89 
 
 		 493 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.52 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.52 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  22.43 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  33.8 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.8 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  27.07 
 
 		 648 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  25.33 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 305 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.47 
 
 		 486 aa  53.9  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>