118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2103 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 536 aa  1008    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  53.8 
 
 		 536 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  52.92 
 
 		 575 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  48.41 
 
 		 534 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  53.07 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 586 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  49.39 
 
 		 596 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  51.29 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.18 
 
 		 523 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  39.31 
 
 		 542 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 542 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 542 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 535 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.78 
 
 		 533 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  38.18 
 
 		 523 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  36.16 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.36 
 
 		 557 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.38 
 
 		 509 aa  123  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.18 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  42.94 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  19.81 
 
 		 537 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  30.29 
 
 		 504 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  39.66 
 
 		 500 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  45.86 
 
 		 558 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  40.98 
 
 		 530 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  31.75 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 524 aa  87.8  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 549 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.2 
 
 		 609 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  40.97 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  28.97 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  50 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  27.46 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  32.29 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  40.14 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.56 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  33.56 
 
 		 538 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  44.64 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.58 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  31.48 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  41.84 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  38.21 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.34 
 
 		 601 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  34.04 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  30.15 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  25.81 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.89 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.49 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  35.33 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.38 
 
 		 445 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  35.29 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  23.8 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  32.3 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  29.92 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  28 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 405 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  38.36 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  32.31 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  33.12 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.17 
 
 		 459 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  34.31 
 
 		 616 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  27.52 
 
 		 553 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.56 
 
 		 379 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  25.59 
 
 		 554 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.66 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  27.68 
 
 		 520 aa  53.9  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  28.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  28.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  26.69 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  23.44 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 494 aa  50.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  21.71 
 
 		 540 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.15 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.15 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  29.18 
 
 		 648 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  22.15 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.17 
 
 		 739 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>