147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4239 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 530 aa  1004    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  43.23 
 
 		 557 aa  342  9e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  41.5 
 
 		 543 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.91 
 
 		 596 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  31.95 
 
 		 536 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  32.5 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  28.73 
 
 		 534 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 546 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  32.5 
 
 		 539 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  31.53 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  31.14 
 
 		 532 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  37.01 
 
 		 547 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.06 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.04 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.37 
 
 		 542 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.24 
 
 		 509 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  41.95 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  29.36 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  46.2 
 
 		 523 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  30.72 
 
 		 558 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  42.31 
 
 		 549 aa  99.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  29.48 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  20.97 
 
 		 555 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 553 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 494 aa  94.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  27.33 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.41 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  33.95 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 524 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  34.1 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  33.53 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.16 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  33.14 
 
 		 519 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  27.98 
 
 		 585 aa  77  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.51 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.14 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.95 
 
 		 601 aa  72.4  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.69 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  32.76 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  27.89 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.02 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.86 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.86 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.32 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  31.82 
 
 		 531 aa  67  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  31.15 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  31.68 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  28.61 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  37.76 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.76 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  37.74 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  32.73 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  31.03 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 609 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  28.21 
 
 		 487 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.13 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  24.57 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  21.54 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  30.71 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  28.32 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  53.45 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  33.81 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  33.11 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  40 
 
 		 562 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  41.82 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  30.75 
 
 		 365 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  34.9 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  29.14 
 
 		 645 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  31.4 
 
 		 442 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.59 
 
 		 445 aa  53.5  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  27.8 
 
 		 512 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  25.42 
 
 		 627 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  33.03 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  33.03 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  33.03 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.03 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.03 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.03 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  31.33 
 
 		 616 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 460 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 405 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>