288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1957 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 485 aa  921    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  49.19 
 
 		 486 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  49.9 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  47.81 
 
 		 502 aa  289  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  42.6 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  45.26 
 
 		 598 aa  176  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.54 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  32.94 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  30.68 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  29.77 
 
 		 478 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.67 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  48.84 
 
 		 558 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  29.63 
 
 		 555 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.11 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.58 
 
 		 565 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  49.66 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  41.59 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  31.55 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  30.16 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  37.84 
 
 		 531 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  26.77 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  29.21 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.4 
 
 		 555 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 586 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.14 
 
 		 492 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.04 
 
 		 502 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.68 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.14 
 
 		 492 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 517 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  29.8 
 
 		 532 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  27.17 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.68 
 
 		 596 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.84 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  37.97 
 
 		 454 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.86 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 546 aa  88.2  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  29.28 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  32.23 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.67 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  31.6 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  36.13 
 
 		 536 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.42 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  41.38 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  48.68 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  39.62 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  35.09 
 
 		 542 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 542 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 542 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  39.57 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  34.57 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 563 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  39.45 
 
 		 549 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.51 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 549 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  37.58 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.72 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  32.76 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  32.55 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  26.19 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  24.1 
 
 		 493 aa  67  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  38.75 
 
 		 739 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  35.04 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  39.55 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  35.25 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.25 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.61 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  37.33 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.97 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25.52 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.59 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  37.33 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.52 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  25.19 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  40.62 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.6 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  37.1 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  36.89 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  39.29 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  33.67 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  47.54 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 740 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  35.11 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  55.22 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>