163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3698 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 549 aa  1068    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  49.91 
 
 		 582 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  28.85 
 
 		 500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  29.92 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  28.26 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 546 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.93 
 
 		 509 aa  94  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  33.18 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 586 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  33.64 
 
 		 536 aa  87.4  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.08 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  26.58 
 
 		 539 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  29.79 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.94 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 535 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  33.15 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  35.42 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.04 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  27.66 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  30.91 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  34.32 
 
 		 531 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.88 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.31 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  39.29 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  35.15 
 
 		 481 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  30.12 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.13 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  35.05 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.36 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  30.64 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  33.91 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.45 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.45 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  33.71 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  41.98 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.48 
 
 		 480 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 609 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.94 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  38.27 
 
 		 665 aa  60.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  39.51 
 
 		 648 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  36.59 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  32.48 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  32.48 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  26.53 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  38.27 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  38.64 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.51 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  34.66 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 312 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  24 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  31.96 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  26.83 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  30.84 
 
 		 486 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.48 
 
 		 501 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  30.5 
 
 		 616 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  23.5 
 
 		 371 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 553 aa  54.3  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.16 
 
 		 502 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  31.46 
 
 		 510 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.17 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  33.94 
 
 		 553 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 374 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.87 
 
 		 601 aa  53.5  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.35 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 637 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  22.5 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  35.48 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  31.46 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  34.57 
 
 		 644 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  23 
 
 		 371 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  31.65 
 
 		 647 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  22.5 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  22.5 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  22.5 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  28.74 
 
 		 538 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  35.62 
 
 		 639 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  22.5 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  45.33 
 
 		 399 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  34.15 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  30.86 
 
 		 739 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 516 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  27.5 
 
 		 371 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 416 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>