243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6672 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  74.02 
 
 		 537 aa  754    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  67.84 
 
 		 538 aa  663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 520 aa  1021    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  46.79 
 
 		 609 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  43.25 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.32 
 
 		 601 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 553 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  37.74 
 
 		 618 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  41.59 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.31 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.82 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  22.53 
 
 		 562 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 494 aa  134  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.3 
 
 		 558 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  28 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  32.29 
 
 		 543 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  59.05 
 
 		 170 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.74 
 
 		 525 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.66 
 
 		 537 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  28.41 
 
 		 536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.4 
 
 		 542 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  29.74 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  29.97 
 
 		 619 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  26.68 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  27.49 
 
 		 627 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 477 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  29.34 
 
 		 501 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  28.79 
 
 		 575 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  23.21 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.44 
 
 		 740 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  30.39 
 
 		 562 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.72 
 
 		 739 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  26.46 
 
 		 408 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.51 
 
 		 407 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 		 616 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  27.48 
 
 		 566 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  28.61 
 
 		 614 aa  90.1  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 546 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  26.97 
 
 		 557 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  24.65 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  23.1 
 
 		 413 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  27.12 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  26.7 
 
 		 645 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.96 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  26.93 
 
 		 665 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  28.43 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  28.06 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  26.09 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  24.77 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  27.71 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.57 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  35.51 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.49 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  29.17 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  27.11 
 
 		 705 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  29.41 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.98 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.74 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  26.83 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  26.32 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  26.74 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  26.74 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.74 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  26.74 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.74 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 563 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  30.92 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  37.5 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  23.24 
 
 		 409 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 552 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  23.42 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  25.45 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  23.04 
 
 		 436 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  28.79 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  29.01 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.8 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  25.42 
 
 		 647 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  27.18 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  36.08 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  31.1 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  31.93 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  25.46 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  28.48 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.48 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.48 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>