112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3231 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  87.99 
 
 		 596 aa  964    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 586 aa  1123    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  53.25 
 
 		 575 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  51.97 
 
 		 536 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  52.05 
 
 		 566 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  48.71 
 
 		 534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  51.26 
 
 		 547 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  49.91 
 
 		 536 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  40.68 
 
 		 542 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 542 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 542 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.32 
 
 		 523 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  35.52 
 
 		 532 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.8 
 
 		 533 aa  198  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.77 
 
 		 557 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  46 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  40.11 
 
 		 539 aa  117  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 558 aa  112  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  49.48 
 
 		 530 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.87 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  28.06 
 
 		 542 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  37.57 
 
 		 500 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  40.48 
 
 		 485 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  30.17 
 
 		 555 aa  97.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  39.44 
 
 		 558 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  30.26 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  27.16 
 
 		 538 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 549 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  39.29 
 
 		 425 aa  87.4  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 		 519 aa  87  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 516 aa  87  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 517 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  43.1 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  42.38 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  36.21 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  37.21 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  41.8 
 
 		 582 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  37.34 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  36.43 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  31.03 
 
 		 598 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  30.97 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  34.84 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.87 
 
 		 601 aa  71.6  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  36.89 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  36.89 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.89 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  37.69 
 
 		 236 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  30.6 
 
 		 478 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  36.89 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.33 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.33 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.89 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.97 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.89 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  24.18 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.6 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.72 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  38.33 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.78 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  34.15 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.33 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  37.59 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.61 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  31.06 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  27.59 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  30.38 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  34.13 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  35.35 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.35 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 412 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  36.91 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 429 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.32 
 
 		 486 aa  54.7  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 429 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 429 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  32.62 
 
 		 505 aa  53.9  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  28.16 
 
 		 665 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  36.27 
 
 		 616 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 515 aa  51.2  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  31.98 
 
 		 525 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  38.14 
 
 		 619 aa  51.2  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 501 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  28.83 
 
 		 618 aa  50.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  31.08 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  37.59 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  34.18 
 
 		 510 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.41 
 
 		 565 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>