76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0676 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  336  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  57.94 
 
 		 538 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  59.05 
 
 		 520 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  55.24 
 
 		 609 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  48.31 
 
 		 585 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  57.14 
 
 		 618 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  48.11 
 
 		 438 aa  95.5  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.5 
 
 		 601 aa  91.3  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 553 aa  64.7  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  30.77 
 
 		 740 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  40.4 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  36.45 
 
 		 616 aa  57.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  29.52 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  39.22 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.88 
 
 		 410 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.88 
 
 		 410 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.88 
 
 		 410 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.88 
 
 		 410 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.88 
 
 		 410 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.88 
 
 		 410 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.88 
 
 		 410 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  36.04 
 
 		 525 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  36.04 
 
 		 525 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  35.65 
 
 		 501 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 553 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  34.15 
 
 		 486 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.38 
 
 		 425 aa  47.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 524 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 		 413 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  30.69 
 
 		 518 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  37.7 
 
 		 404 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 405 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  28 
 
 		 410 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  34.18 
 
 		 515 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  31.43 
 
 		 705 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.29 
 
 		 558 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 561 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 552 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 403 aa  44.3  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  31 
 
 		 542 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 405 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  40.98 
 
 		 543 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 477 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  35.58 
 
 		 389 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  35.78 
 
 		 418 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  29.52 
 
 		 404 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 539 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.27 
 
 		 379 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 494 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 520 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  28.95 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 405 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 420 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.96 
 
 		 555 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  35.44 
 
 		 505 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  39.47 
 
 		 438 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  32.95 
 
 		 637 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  39.34 
 
 		 538 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 		 514 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  31.52 
 
 		 418 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 564 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 558 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  34.74 
 
 		 543 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  27.59 
 
 		 371 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  34.02 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  26.21 
 
 		 562 aa  40.8  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  30.48 
 
 		 311 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  28.89 
 
 		 510 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 528 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  34.72 
 
 		 416 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 390 aa  40.8  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  26.81 
 
 		 408 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 517 aa  40.8  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 429 aa  40.8  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>