272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0431 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 514 aa  984    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  41.03 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  42.22 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  31.08 
 
 		 498 aa  88.2  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 553 aa  87.4  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  34.58 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  30.4 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  32.52 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 305 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  32.68 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  29.64 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  28.65 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  32.37 
 
 		 645 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  36.05 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.85 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  34.25 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  42.31 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  33.12 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  36.05 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.2 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  31.75 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  35.44 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  55.93 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  35.29 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  30.61 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.51 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.51 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  20.7 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  32.77 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  24.69 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  29.29 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  27.41 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  50 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.12 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.62 
 
 		 385 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  50 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  50.79 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.12 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  50 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.12 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.12 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.12 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  30.82 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.51 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  39.42 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.56 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  33.13 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27.74 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  31.91 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  33.73 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.91 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.72 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.91 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  31.91 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  40.31 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.91 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  45.71 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.06 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  31.91 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  26.71 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.91 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  29.35 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  23.23 
 
 		 381 aa  57  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  35.34 
 
 		 554 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.68 
 
 		 520 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.3 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.12 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  38.74 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  24.14 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  39.42 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  33.99 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  48.61 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  33.99 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  23.13 
 
 		 537 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  33.99 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.79 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  31.79 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.86 
 
 		 739 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  31.79 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.79 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.79 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.79 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  43.04 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  43.59 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  31.09 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 405 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  40.2 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  33.57 
 
 		 705 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 597 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>