211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1323 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 554 aa  1096    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 552 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 553 aa  93.6  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 558 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  27.86 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  19.35 
 
 		 555 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  29.14 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  27.63 
 
 		 665 aa  71.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  31.65 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.6 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.17 
 
 		 525 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  28.42 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.21 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  27.99 
 
 		 648 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  29.04 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  34.85 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  25.66 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  22.06 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  18.72 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.07 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  24.69 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  28.92 
 
 		 600 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  34.45 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  28.09 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  33.13 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  25.69 
 
 		 627 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  33.04 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  21.97 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  30.87 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  23.43 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 361 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  33.67 
 
 		 519 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  24.07 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  39.71 
 
 		 407 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  28.37 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  19.85 
 
 		 412 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  33.61 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.61 
 
 		 364 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.5 
 
 		 385 aa  55.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  34.56 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  39.53 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 371 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  37.4 
 
 		 397 aa  54.7  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.3 
 
 		 509 aa  54.7  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 385 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  31.97 
 
 		 375 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  28.99 
 
 		 644 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.25 
 
 		 385 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  26.71 
 
 		 741 aa  53.9  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  28.36 
 
 		 405 aa  53.9  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  24.79 
 
 		 520 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 436 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  31.25 
 
 		 385 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  31.25 
 
 		 385 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.25 
 
 		 385 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.25 
 
 		 376 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.25 
 
 		 385 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.28 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  37.93 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  36.57 
 
 		 362 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.45 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.88 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.88 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.68 
 
 		 740 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  39.52 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.88 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  31.65 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.22 
 
 		 618 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.88 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.88 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  28.31 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.03 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  22.01 
 
 		 380 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  35.79 
 
 		 510 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  34.4 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  27.88 
 
 		 558 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.63 
 
 		 501 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 552 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.03 
 
 		 385 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  26.12 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 515 aa  50.4  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  31.01 
 
 		 328 aa  50.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.64 
 
 		 739 aa  50.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  24.83 
 
 		 383 aa  50.4  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  23.11 
 
 		 650 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.18 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  19.85 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  23.97 
 
 		 538 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  26.57 
 
 		 403 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>