197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0753 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  805    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  94.74 
 
 		 399 aa  767    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  24.39 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  23.44 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  23.43 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.43 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.43 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  23.43 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  23.43 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.43 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  21.41 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  21.63 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 		 555 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  35.56 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  33.59 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.8 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  28.17 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  32.74 
 
 		 562 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 525 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  27.68 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  31.29 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.06 
 
 		 740 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.9 
 
 		 665 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  27.93 
 
 		 637 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.59 
 
 		 486 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  26.79 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  32.58 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  25.66 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  29.75 
 
 		 619 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  28.12 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  28.35 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  28.36 
 
 		 739 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  29.84 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  32.8 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.23 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  28.99 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  24.91 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.95 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  29.46 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  22.42 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  32.58 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  21.26 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  32.59 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.33 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  30.43 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  28.79 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  21.74 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  27.42 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  22.68 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  29.07 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  26.01 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  26.4 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  24.74 
 
 		 562 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  27.36 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  41.79 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  26.19 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.78 
 
 		 509 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27.74 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.93 
 
 		 502 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.93 
 
 		 492 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 516 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.93 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  26.32 
 
 		 585 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 502 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  20.5 
 
 		 558 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  26.67 
 
 		 600 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 553 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  27.69 
 
 		 520 aa  53.5  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  43.4 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  34.25 
 
 		 519 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  32.47 
 
 		 627 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  31.4 
 
 		 563 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 		 741 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  23.97 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.13 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  33.8 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 597 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  28.21 
 
 		 515 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 557 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>