254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1801 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 562 aa  1150    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  26.44 
 
 		 555 aa  193  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  23.75 
 
 		 558 aa  174  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  23.06 
 
 		 538 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  24.03 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  21.83 
 
 		 520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.93 
 
 		 542 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  20.28 
 
 		 585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  17.41 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  21.43 
 
 		 609 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  23.54 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.31 
 
 		 412 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.27 
 
 		 601 aa  84.7  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 		 705 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  28.06 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  20.71 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  20.27 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  21.55 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 563 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 597 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  26.46 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.53 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  25.56 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  19.93 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.97 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  25.82 
 
 		 536 aa  73.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  20.74 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  27.41 
 
 		 404 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  20.75 
 
 		 741 aa  72.4  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  19.96 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  26.54 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  20.35 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  20.27 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  19.08 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  20.27 
 
 		 502 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  20.55 
 
 		 602 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  20.27 
 
 		 492 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  19.09 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  22.35 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  21.2 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  26.67 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  28.01 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  23.77 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  18.49 
 
 		 618 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  25.27 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  30.28 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  22.4 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  19.81 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  19.38 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.66 
 
 		 740 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  25.14 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.48 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  22.31 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  26.38 
 
 		 438 aa  63.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  27.78 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  27.15 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  26.79 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  20.64 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  26.18 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  24.6 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  24 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  28.1 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  28.86 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  26.79 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  26.19 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  24.33 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  29.03 
 
 		 520 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  18.07 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  22.86 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.63 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25.53 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  20.25 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  31.97 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  25.82 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.82 
 
 		 410 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.82 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  25.82 
 
 		 410 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  24.74 
 
 		 399 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  25.75 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  25.82 
 
 		 410 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.82 
 
 		 410 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  17.38 
 
 		 515 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  18.99 
 
 		 600 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>