209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1633 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 		 601 aa  1208    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  38.95 
 
 		 538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  37.8 
 
 		 520 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  34.6 
 
 		 585 aa  269  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.61 
 
 		 609 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  34.38 
 
 		 618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.72 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 558 aa  163  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  32.86 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  41.88 
 
 		 562 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  24.61 
 
 		 558 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  42.5 
 
 		 170 aa  91.3  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 403 aa  90.5  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 494 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 520 aa  87  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  25.97 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  37.21 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  25.82 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.29 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.27 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  23.08 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 564 aa  84  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  35.42 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.55 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 659 aa  80.5  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  27.86 
 
 		 510 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  23.73 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  35.06 
 
 		 741 aa  78.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  22.9 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 361 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  24.8 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.79 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  24.86 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  26.88 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  24.07 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.5 
 
 		 480 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  32.41 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  25.17 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  27.97 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  29.27 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  26.14 
 
 		 616 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  26.49 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.41 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  31.3 
 
 		 362 aa  67  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.34 
 
 		 596 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  31.93 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  28.47 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  23.63 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  30.97 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  22.84 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  23.66 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.22 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  32.11 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  28.23 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 552 aa  63.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.51 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.51 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.51 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.51 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.51 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.51 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.14 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  30.11 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  23 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.81 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 235 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  25.9 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  26.22 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  26.61 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  30.19 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  36.67 
 
 		 416 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  26.34 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  26.17 
 
 		 614 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  42.68 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.74 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  30.24 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  31.69 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  25.75 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.67 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  38.2 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  25.61 
 
 		 547 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.67 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.67 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  25.3 
 
 		 566 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  43.04 
 
 		 517 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  24.54 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 405 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>