203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3098 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 361 aa  700    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  58.97 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  44.18 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  37.73 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  37.77 
 
 		 365 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  34.32 
 
 		 442 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  45.54 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  43.56 
 
 		 402 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  44.9 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.08 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  39.6 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  39.57 
 
 		 741 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.02 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  23.48 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  26.2 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  29.29 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  28.75 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  28.75 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  28.75 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.65 
 
 		 518 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 564 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  34.44 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 563 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  31.85 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  31.43 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  27.19 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  40.77 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  40.94 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.7 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  28.12 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 553 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  30.28 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.19 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  28.15 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  29.23 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  27.94 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  27.86 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  24.48 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  29.58 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  25.44 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  25.44 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  25.44 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  25.15 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  33.83 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.59 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  25.88 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  26.88 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  29.67 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  26.88 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  34.16 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.34 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  49.15 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  29.18 
 
 		 502 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  23.91 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  25.81 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  21.19 
 
 		 562 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  26.34 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 514 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  35.33 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  33.79 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  26.79 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  33.79 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  33.79 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  32.67 
 
 		 554 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  32.93 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  33.79 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.79 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.79 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.79 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  46.03 
 
 		 480 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  32.28 
 
 		 418 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  29.09 
 
 		 399 aa  52.8  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  33.33 
 
 		 524 aa  52.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  19.02 
 
 		 518 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.52 
 
 		 385 aa  52.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.58 
 
 		 558 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  46.67 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  33.78 
 
 		 537 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  23.95 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  23.37 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  45.31 
 
 		 538 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  35.54 
 
 		 609 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  31.85 
 
 		 705 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  26.3 
 
 		 511 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.88 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  34.06 
 
 		 547 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>