249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4740 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 515 aa  994    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38.64 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  37.71 
 
 		 514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  39.37 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 552 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.31 
 
 		 501 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  31.88 
 
 		 543 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  28.77 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.77 
 
 		 480 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  45.73 
 
 		 561 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  24.65 
 
 		 493 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  28.04 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.76 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.85 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.7 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  26.24 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.02 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  38.85 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 659 aa  68.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  40.34 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.49 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  40.62 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  17.59 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.62 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.19 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  29.14 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  29.83 
 
 		 598 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  33.09 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  37.76 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.03 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  27.5 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  38 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  30.4 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  25.86 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.51 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  29.61 
 
 		 535 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.33 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 739 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  32 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.05 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  39.67 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  28.8 
 
 		 413 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  37.07 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.84 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  26.28 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  30.15 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  24.91 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  27.75 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  35.16 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  29.5 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  35.16 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  35.54 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  44.19 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  46.58 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  32.58 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  35.16 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  35.16 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  32.58 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  42.47 
 
 		 619 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  38.16 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25.53 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  34.13 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  43 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  28.33 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  26.4 
 
 		 399 aa  57  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  43.84 
 
 		 644 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  32.13 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.49 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.21 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.49 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.21 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  29.58 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  29.58 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  37.62 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  35.04 
 
 		 236 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  26.26 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  28.95 
 
 		 538 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  39.13 
 
 		 637 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>