237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2967 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 486 aa  931    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  33.93 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.22 
 
 		 505 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  36.79 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  33.71 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 552 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  31.53 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 515 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  43.79 
 
 		 561 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  28.6 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.8 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  41.77 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  29.58 
 
 		 555 aa  66.6  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  35.79 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.79 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  32.79 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  44.3 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  42.5 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  36.13 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  42.31 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.53 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  32.35 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  43.66 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  39.29 
 
 		 665 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  44 
 
 		 681 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  43.59 
 
 		 614 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  33.33 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.63 
 
 		 486 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  39.29 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  32.8 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  38.46 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  48.72 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  39.78 
 
 		 611 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  36.17 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  27.87 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  38.75 
 
 		 627 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  34.18 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.56 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.69 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  32.45 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  37.18 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  35.42 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  22.68 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  39.42 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  41.56 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  33.95 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  45 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 739 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  40.7 
 
 		 519 aa  57  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  32 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  43.59 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  47.14 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  41.33 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  27.34 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  41.82 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  36.25 
 
 		 740 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  36.96 
 
 		 538 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  38.79 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  36.36 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  36.36 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  24.03 
 
 		 534 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  39.76 
 
 		 399 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  44.07 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.84 
 
 		 565 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  36.36 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  36.36 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  30.72 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  39.71 
 
 		 639 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  39.47 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  36.36 
 
 		 371 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 403 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  33.56 
 
 		 502 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  41.1 
 
 		 515 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  41.1 
 
 		 515 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  39.73 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  41.1 
 
 		 515 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 525 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 390 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  23.17 
 
 		 399 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  34.29 
 
 		 371 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  43.48 
 
 		 514 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>