156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2346 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  100 
 
 		 681 aa  1279    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  52 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  46.15 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.78 
 
 		 410 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.78 
 
 		 410 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.78 
 
 		 410 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.78 
 
 		 410 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.78 
 
 		 410 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.78 
 
 		 410 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  44 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 517 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  38.68 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  44 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  33.54 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.57 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  43.56 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  44.87 
 
 		 429 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 281 aa  57  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  44.05 
 
 		 611 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 564 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  46.75 
 
 		 530 aa  55.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 514 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  50 
 
 		 414 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  44.87 
 
 		 393 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  42.65 
 
 		 537 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  33.12 
 
 		 429 aa  54.3  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 403 aa  53.9  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  36.7 
 
 		 540 aa  53.9  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 558 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 553 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  39.13 
 
 		 428 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  39.13 
 
 		 428 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  39.13 
 
 		 428 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  29.09 
 
 		 418 aa  53.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  31.87 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  42.86 
 
 		 511 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.84 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  44.05 
 
 		 520 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 563 aa  52  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 305 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  37.37 
 
 		 454 aa  52  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  31.37 
 
 		 542 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  37.5 
 
 		 486 aa  51.6  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  35.8 
 
 		 600 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 543 aa  51.6  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  41.77 
 
 		 515 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 429 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  41.77 
 
 		 515 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 429 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  41.77 
 
 		 515 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 429 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.51 
 
 		 445 aa  50.8  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  51.06 
 
 		 428 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  40.4 
 
 		 392 aa  50.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  47.27 
 
 		 554 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  47.27 
 
 		 554 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  47.27 
 
 		 554 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.75 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  39.44 
 
 		 639 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  32.1 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  39.24 
 
 		 648 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  48.89 
 
 		 428 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  41.56 
 
 		 538 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  43.01 
 
 		 425 aa  50.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  44.29 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  40.51 
 
 		 644 aa  50.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.85 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 529 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 406 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  34.36 
 
 		 421 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  51.06 
 
 		 413 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  47.54 
 
 		 512 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  40.14 
 
 		 504 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 659 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  32.56 
 
 		 602 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  48.33 
 
 		 429 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0495  CdaR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 645 aa  48.5  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 479 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38.16 
 
 		 505 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  33.02 
 
 		 425 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  52.27 
 
 		 525 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  34.56 
 
 		 425 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  33.95 
 
 		 384 aa  48.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1059  transcriptional regulator, CdaR  46.24 
 
 		 514 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.844441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  45.71 
 
 		 393 aa  47.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  53.33 
 
 		 420 aa  47.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  37.65 
 
 		 547 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  55.17 
 
 		 410 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.51 
 
 		 480 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  40.51 
 
 		 665 aa  47.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 597 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  47.46 
 
 		 539 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  32.69 
 
 		 412 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.69 
 
 		 412 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  35.51 
 
 		 553 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 412 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  37.88 
 
 		 407 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  41.75 
 
 		 491 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 478 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>