188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0076 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 611 aa  1155    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  56.05 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  37.91 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.57 
 
 		 540 aa  282  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  41.13 
 
 		 498 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  38.46 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  38.46 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  38.46 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  37.52 
 
 		 525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  34.55 
 
 		 537 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  33.28 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  30.76 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  32.61 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  34.26 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  34.58 
 
 		 529 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  30.55 
 
 		 512 aa  150  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  31.86 
 
 		 522 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  31.61 
 
 		 522 aa  138  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  30.66 
 
 		 514 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  31.79 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  31.79 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  31.79 
 
 		 515 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  32.17 
 
 		 502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22 
 
 		 410 aa  97.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  32.54 
 
 		 510 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.57 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  42.53 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  44.93 
 
 		 501 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  56 
 
 		 387 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  39.78 
 
 		 486 aa  60.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.97 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  43.66 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  44.05 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  43.42 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  31.78 
 
 		 382 aa  57  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  43.04 
 
 		 514 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  30.88 
 
 		 411 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  34.26 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 547 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 397 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  38.14 
 
 		 418 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  45.95 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 563 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 631 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  26.95 
 
 		 650 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 479 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  34.57 
 
 		 392 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  32.06 
 
 		 412 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  44.78 
 
 		 561 aa  54.3  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  48.53 
 
 		 502 aa  53.9  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  35.16 
 
 		 665 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  26.63 
 
 		 404 aa  53.9  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  38.16 
 
 		 705 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 502 aa  53.9  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  36.54 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  34.9 
 
 		 408 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  41.03 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  26.88 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  38.04 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  38.04 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  38.04 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  44.12 
 
 		 562 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  38.04 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.04 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.04 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.04 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  32.99 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  44.29 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  29.2 
 
 		 407 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  40.28 
 
 		 393 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  27.29 
 
 		 383 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  42.65 
 
 		 226 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  37.97 
 
 		 419 aa  51.6  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  29.36 
 
 		 311 aa  51.6  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 399 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 447 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  32.89 
 
 		 381 aa  51.2  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  44.64 
 
 		 413 aa  50.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 387 aa  50.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 305 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  40.35 
 
 		 383 aa  50.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  38.46 
 
 		 539 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  43.14 
 
 		 418 aa  50.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0552  transcriptional regulator, CdaR  38.98 
 
 		 513 aa  50.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.08 
 
 		 618 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50790  hypothetical protein  34.19 
 
 		 370 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937212  hitchhiker  0.00694417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0942  hypothetical protein  30.56 
 
 		 252 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  34.34 
 
 		 553 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  26.06 
 
 		 740 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.59 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  43.94 
 
 		 411 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2704  transcriptional regulator, CdaR  50.94 
 
 		 412 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>