38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2704 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2704  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 412 aa  830    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  45.05 
 
 		 226 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  21.71 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  37.74 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 529 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  43.84 
 
 		 547 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 518 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  50.94 
 
 		 611 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  38.75 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  36.44 
 
 		 512 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  38.75 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  38.75 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  45 
 
 		 515 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  35.25 
 
 		 525 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  45 
 
 		 515 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  45 
 
 		 515 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 552 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  33.94 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  38.24 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  40.48 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  44.44 
 
 		 681 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  33.09 
 
 		 538 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  36.27 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  43.4 
 
 		 537 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  34.78 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  32.62 
 
 		 530 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  39.13 
 
 		 522 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  43.55 
 
 		 512 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  42.11 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  36.49 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  40.74 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.38 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  51.11 
 
 		 473 aa  42.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>