88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2495 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 399 aa  769    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  59.32 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  55.64 
 
 		 417 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  51.43 
 
 		 416 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  46.77 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  44.27 
 
 		 415 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  39.9 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  40.52 
 
 		 479 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 447 aa  222  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  42.16 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 464 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  39.25 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  37.09 
 
 		 495 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  36.61 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  34.17 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  33.25 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  33.85 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  34.44 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  34.15 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  32.37 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  30.95 
 
 		 412 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  28.9 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  48.54 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  32.65 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  30.42 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  28.25 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  27.55 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  25.13 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  32.46 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  30.24 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  27.88 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  39.33 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  39.33 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  39.33 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  38.3 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  49.15 
 
 		 525 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  28.29 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  28.28 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  45.61 
 
 		 611 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 558 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  40.24 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  26.42 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  44.12 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 529 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  27.79 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  43.75 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  45.59 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  47.17 
 
 		 681 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  47.27 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  37.07 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  31.87 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  32.85 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  27.99 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  56.76 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  45.61 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  47.46 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  39.73 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  46.3 
 
 		 511 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 547 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  44.44 
 
 		 514 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  34.44 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  45.45 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  28.03 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 526 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  38.36 
 
 		 547 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  30.72 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  30.72 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 528 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  30.72 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  43.64 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  35.05 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  38.16 
 
 		 478 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  28.96 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>