295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1333 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 
558 aa  1071    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  32.73 
 
 
510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.02 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  28.84 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.14 
 
 
555 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  31.73 
 
 
481 aa  147  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  47.09 
 
 
486 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  48.84 
 
 
485 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  30.35 
 
 
505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  28.6 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.78 
 
 
520 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  43.17 
 
 
598 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  29.32 
 
 
536 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  29.89 
 
 
514 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  40.8 
 
 
519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
502 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  27.26 
 
 
557 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
517 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  28.84 
 
 
543 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  33.67 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  29.62 
 
 
543 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.43 
 
 
562 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.38 
 
 
480 aa  110  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.61 
 
 
553 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
537 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.85 
 
 
445 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  28.62 
 
 
520 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
516 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.35 
 
 
601 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  44.37 
 
 
483 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  28.78 
 
 
547 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  19.79 
 
 
542 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 
534 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  46.67 
 
 
487 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  28.27 
 
 
566 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  24.41 
 
 
502 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.23 
 
 
492 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.16 
 
 
492 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  41.03 
 
 
549 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  27.78 
 
 
539 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
586 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  27.21 
 
 
528 aa  94.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  41.73 
 
 
515 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  19.65 
 
 
537 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  38.98 
 
 
536 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
535 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
546 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  39.29 
 
 
500 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  35.11 
 
 
535 aa  91.3  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.26 
 
 
596 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  25.95 
 
 
515 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.44 
 
 
618 aa  87.4  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  31.92 
 
 
525 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  26.19 
 
 
575 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  39.53 
 
 
501 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  38.03 
 
 
531 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.82 
 
 
565 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 
456 aa  84  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.07 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
549 aa  82  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  29.87 
 
 
585 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  44.55 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.34 
 
 
509 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.55 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.61 
 
 
558 aa  80.5  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  30.98 
 
 
542 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  30.98 
 
 
542 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  30.98 
 
 
542 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  38.06 
 
 
454 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  33.84 
 
 
555 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  32.06 
 
 
500 aa  77  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
429 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  33.13 
 
 
538 aa  76.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  28.73 
 
 
665 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
429 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.16 
 
 
523 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
429 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  29.91 
 
 
609 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  37.7 
 
 
525 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  24.03 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  38.19 
 
 
512 aa  73.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  31 
 
 
553 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  28.53 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  44.25 
 
 
502 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
235 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  34.67 
 
 
582 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  24.15 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.22 
 
 
740 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 
739 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  24.59 
 
 
518 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 
415 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  45.68 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.47 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  27.56 
 
 
627 aa  67.4  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  24.61 
 
 
361 aa  67  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.28 
 
 
619 aa  67  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.54 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>